Елена Рыболовлева подала на развод с супругом в 2008 году в Швейцарии по месту проживания. Суд в марте 2010 года вынес постановление заморозить основные активы бывшего владельца «Уралкалия» Дмитрия Рыболовлева (№14 в рейтинге 200 богатейших бизнесменов России по версии Forbes, состояние — $9,1 млрд), чтобы разделить имущество супругов.
Далее, по данным Елены Рыболовлевой, ее муж продал крупные пакеты акций «Уралкалия» (63%) и «Сильвинита» (25%), а на вырученные деньги купил особняк на Гавайях за $20 млн у актера Уилла Смита, дом американского бизнесмена Дональда Трампа за $95 млн, пентхаус в Нью-Йорке за $88 млн и пентхаус в Монако за $300 млн. Именно в Монако, полагает Рыболовлева, сейчас проживает бизнесмен вместе с одной из двух их общих дочерей. Елена также нашла у мужа доли в Банке Кипра, футбольном клубе «Монако» и два греческих острова, которые он приобрел в апреле у внучки Аристотеля Онассиса. Она полагает, что предприниматель оформил все эти активы на их дочь или компанию Kapha, чтобы не делиться ими с женой.
Елена Рыболовлева подавала ходатайства на арест имущества своего мужа в суды разных стран (Кипр, США, Британские Виргинские острова и Лондон, Сингапур), где он приобретал новые активы. В 2013 году супруги почти договорились о подписании мирового соглашения, но в последний момент кто-то из них подписывать его отказался. Кто именно - неизвестно, Елена Рыболовлева винит в этом своего супруга, представители Дмитрия Рыболовлева говорят, что подписание было сорвано по вине жены.
Представители бизнесмена также утверждали, что Елена Рыболовлева проиграла все суды за пределами Швейцарии (в Сингапуре, на Кипре и Британских Виргинских островах), которые сначала вынесли, а потом отменили постановления о заморозке активов предпринимателя. Компании, которые оспаривает супруга, были созданы Дмитрием Рыболовлевым в интересах их общих детей задолго до начала бракоразводного процесса, подчеркивают представители бизнесмена. А сам предприниматель разводиться никогда не хотел, и первые шесть месяцев после начала суда даже пытался спасти брак, заявили Forbes представители Рыболовлева.
В мае 2014 года cуд Женевы присудил половину состояния Дмитрия Рыболовлева в размере 4 млрд швейцарских франков (€3,3 млрд) его бывшей супруге Елене. Она также получила права опеки над их младшей 13-летней дочерью. Швейцарское правосудие предписало российскому миллиардеру передать своей бывшей жене принадлежащую ему недвижимость в городе Колони, недалеко от Женевы.